Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf4E9QAP7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf4E9QAP7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf4E9QAP7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf4E9QAP7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf4E9QAP7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms