Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4930451I11RikE9Q9R3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930451I11RikE9Q9R3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930451I11RikE9Q9R3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4930451I11RikE9Q9R3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930451I11RikE9Q9R3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930451I11RikE9Q9R3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930451I11RikE9Q9R3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
4930451I11RikE9Q9R3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930451I11RikE9Q9R3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
4930451I11RikE9Q9R3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930451I11RikE9Q9R3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms