Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm17175E9Q528 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm17175E9Q528 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm17175E9Q528 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17175E9Q528 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17175E9Q528 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17175E9Q528 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm17175E9Q528 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17175E9Q528 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm17175E9Q528 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm17175E9Q528 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm17175E9Q528 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm17175E9Q528 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm17175E9Q528 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm17175E9Q528 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm17175E9Q528 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm17175E9Q528 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm17175E9Q528 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm17175E9Q528 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm17175E9Q528 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm17175E9Q528 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17175E9Q528 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17175E9Q528 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17175E9Q528 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17175E9Q528 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17175E9Q528 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17175E9Q528 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm17175E9Q528 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17175E9Q528 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17175E9Q528 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17175E9Q528 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm17175E9Q528 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms