Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl3E0CZ16 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klhl3E0CZ16 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl3E0CZ16 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms