Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppfia4B8QI36 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfia4B8QI36 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfia4B8QI36 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfia4B8QI36 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms