Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spocd1B1ASB6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Spocd1B1ASB6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spocd1B1ASB6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spocd1B1ASB6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spocd1B1ASB6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.3 ms