Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prr16A3KMN5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prr16A3KMN5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prr16A3KMN5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prr16A3KMN5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prr16A3KMN5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prr16A3KMN5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prr16A3KMN5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prr16A3KMN5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.6 ms