Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rhox3fA2ANE1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox3fA2ANE1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhox3fA2ANE1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms