Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B020011L13RikA0A087WQI7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms