Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPJ1

1700017N19Rik, RIKEN cDNA 1700017N19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700017N19RikA0A087WPJ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms