Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm3238W4VSP7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm3238W4VSP7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm3238W4VSP7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3238W4VSP7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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