Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vstm4T1NXB5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms