Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms