Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Cldn7Q9Z261 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cldn7Q9Z261 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cldn7Q9Z261 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn7Q9Z261 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn7Q9Z261 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn7Q9Z261 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn7Q9Z261 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn7Q9Z261 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cldn7Q9Z261 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cldn7Q9Z261 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cldn7Q9Z261 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn7Q9Z261 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms