Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms