Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn9Q9Z0S7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms