Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pacsin2Q9WVE8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms