Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms