Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnni1Q9WUZ5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms