Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP3

Spdef, SAM pointed domain-containing Ets transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpdefQ9WTP3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SpdefQ9WTP3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SpdefQ9WTP3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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