Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms