Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Plod3Q9R0E1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms