Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav3Q9R0C8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms