Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek3Q9R0A5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms