Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gpc6Q9R087 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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