Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a4Q9QZR9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Col4a4Q9QZR9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Col4a4Q9QZR9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Col4a4Q9QZR9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Col4a4Q9QZR9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Col4a4Q9QZR9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Col4a4Q9QZR9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a4Q9QZR9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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