Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ercc4Q9QZD4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc4Q9QZD4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms