Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VapbQ9QY76 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms