Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp3Q9QY23 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp3Q9QY23 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms