Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Opn4Q9QXZ9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Opn4Q9QXZ9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn4Q9QXZ9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn4Q9QXZ9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn4Q9QXZ9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn4Q9QXZ9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Opn4Q9QXZ9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Opn4Q9QXZ9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn4Q9QXZ9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn4Q9QXZ9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn4Q9QXZ9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn4Q9QXZ9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn4Q9QXZ9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn4Q9QXZ9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Opn4Q9QXZ9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms