Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nufip1Q9QXX8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms