Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Kcnip3Q9QXT8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms