Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim44Q9QXA7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms