Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Dkk3Q9QUN9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Dkk3Q9QUN9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Dkk3Q9QUN9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Dkk3Q9QUN9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Dkk3Q9QUN9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Dkk3Q9QUN9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Dkk3Q9QUN9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Dkk3Q9QUN9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Dkk3Q9QUN9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dkk3Q9QUN9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Dkk3Q9QUN9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms