Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Csnk1eQ9JMK2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Csnk1eQ9JMK2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Csnk1eQ9JMK2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Csnk1eQ9JMK2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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