Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col5a3Q9JLI2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms