Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hip1rQ9JKY5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hip1rQ9JKY5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hip1rQ9JKY5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hip1rQ9JKY5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hip1rQ9JKY5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hip1rQ9JKY5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hip1rQ9JKY5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hip1rQ9JKY5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hip1rQ9JKY5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hip1rQ9JKY5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hip1rQ9JKY5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hip1rQ9JKY5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hip1rQ9JKY5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hip1rQ9JKY5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hip1rQ9JKY5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms