Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk3aQ9JKX8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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