Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Habp4Q9JKS5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Habp4Q9JKS5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms