Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nova1Q9JKN6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms