Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl39Q9JKF7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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