Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms