Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms