Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc22Q9JIG7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms