Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms