Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms