Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PalldQ9ET54 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PalldQ9ET54 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PalldQ9ET54 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PalldQ9ET54 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PalldQ9ET54 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PalldQ9ET54 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PalldQ9ET54 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PalldQ9ET54 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PalldQ9ET54 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PalldQ9ET54 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PalldQ9ET54 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PalldQ9ET54 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PalldQ9ET54 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms