Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cldn12Q9ET43 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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