Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trim39Q9ESN2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trim39Q9ESN2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trim39Q9ESN2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim39Q9ESN2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim39Q9ESN2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Trim39Q9ESN2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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