Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtofQ9ESF1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtofQ9ESF1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms